I regel får vattenhushållningsprojektet påbörjas när regionförvaltningsverket har fattat ett positivt beslut som har vunnit laga kraft. Tillståndsbeslutet vinner laga kraft 38 dagar efter att beslutet meddelades och det inte har överklagats hos Vasa förvaltningsdomstol.
Om det finns grundad anledning kan sökanden emellertid ansöka om tillstånd till förberedelser i samband med tillståndsansökan. Det innebär tillstånd att vidta förberedande åtgärder för genomförande av projektet redan innan beslutet har vunnit laga kraft. Sökanden ska motivera behovet av tillstånd till förberedelser och specificera vilka åtgärder den har tänkt vidta. Regionförvaltningsverket behandlar tillståndet till förberedelser samtidigt med tillståndsansökan för vattenhushållningsprojektet och meddelar ett beviljande eller avslående beslut.
Om regionförvaltningsverket beviljar tillstånd till förberedelser ålägger den sökanden att betala en säkerhet innan arbetena inleds, om det inte är uppenbart onödigt. Kravet på att ställa säkerhet gäller inte staten och dess inrättningar och inte heller kommuner och samkommuner. Säkerheten ska täcka ersättningen för de skador, olägenheter och kostnader som kan uppstå om beslutet upphävs eller tillståndsvillkoren ändras.
Sökanden kan ansöka om tillstånd till förberedelser också under besvärstidens gång eller inom 14 dagar efter besvärstidens utgång. Den görs med en separat ansökan. Regionförvaltningsverket hör tillsynsmyndigheterna och dem som har överklagat tillståndsbeslutet om ansökan om tillstånd till förberedelser.