Lupapäätös on pääsääntöisesti lopullinen. Lupaa voidaan kuitenkin muuttaa tietyissä tapauksissa.
Luvanhaltijalta edellytetään muutoshakemuksen tekemistä, jos toiminnassa on tapahtunut olennaisia muutoksia.
Luvan muuttamista voi hakea sekä luvanhaltija hakemuksella, että jokin muu taho tekemällä aloitteen.
Lupaa valvova viranomainen tai haitankärsijä voi tehdä aloitteen luvan muuttamiseksi, jos
- toiminnasta aiheutuvat seuraukset poikkeavat olennaisesti ennalta arvioidusta
- toiminnan ympäristön olosuhteet ovat muuttuneet olennaisesti
- paras käyttökelpoinen tekniikka on kehittynyt siten, että päästöjä voidaan olennaisesti vähentää ilman kohtuuttomia kustannuksia
- muutos täytyy tehdä toimintaa rajoittavien säädösmuutosten takia.
Aloitteessa täytyy perustella, miksi lupaan esitetään muutoksia.
Luvan muuttaminen voidaan käsitellä usein tavanomaista keveämmin. Hyvään hallintoon kuuluu kuitenkin kaikkien asianosaisten riittävä kuuleminen.